乳腺癌研究人员和生物信息学家的共同努力为推动乳房发育的分子变化提供了新的见解。

　　研究小组比较了乳腺(乳腺组织)单细胞中表达的基因，以了解发育过程中发生的广泛的分子变化。这揭示了青春期前后基因表达的巨大变化，并使研究小组能够识别出以前未被识别的乳腺细胞类型。

　　乳房是如何发育的?

　　乳房组织由干细胞发育而来，干细胞在怀孕后分裂和分化为产生和释放乳汁所需的细胞。

　　由Jane Visvader教授、Gordon Smyth教授和Geoff Lindeman教授领导的一个研究所研究小组，包括Bhupinder Pal博士、Yunshun Chen博士和franois Vaillant博士，研究了乳房发育过程中发生的分子变化。他们的研究发表在《自然通讯》杂志上。

　　维维德教授与林德曼教授共同领导着该研究所的乳腺癌研究项目。他说，研究小组关注的是乳房在青春期之前、期间和之后的变化。她说:“我们通过对数千个细胞进行分析，在全球水平上比较了哪些基因是由乳腺细胞表达的——它们的转录组。”“这让我们发现了发生在青春期附近的转录程序的巨大变化，这是细胞致力于成为不同类型的成年细胞的时候。”在此之前，在青春期前的乳房中，细胞都处于相对相似的未成熟状态。”

　　维维德教授说，这些发现对了解乳腺癌的发病机制具有重要意义。“这种技术可以用来了解女性哪些细胞出现了问题，从而增加了患乳腺癌的风险。此外，这项技术提供了一种更深入研究乳腺癌异质性的新方法，”她说。

　　放大到单个细胞

　　该研究所生物信息学部门负责人戈登·史密斯(Gordon Smyth)教授说，这项发现的关键是一项名为单细胞rna测序的新技术，研究人员可以通过这项技术确定数百到数千个细胞的转录组。

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　　“我们能够运用我们在生物信息学方面的专业知识来区分乳腺中不同的细胞群，”他说。“这揭示了影响乳房发育的基因表达程序的惊人变化。”

　　这项研究的一个重要方面是，它使用了该研究所现有的两种不同的转录组学技术。一种技术平台可以对数百个细胞进行深度测序，而另一种技术平台可以对数千个细胞进行测序，尽管深度较低。

　　史密斯教授说:“这种使用两个测序平台的双重方法使我们能够全面调查研究问题，比单独使用任何一个平台都更有力。”

　　协作的力量

　　林德曼教授说，这项研究是生物学家、生物信息学家和技术专家之间多学科合作的一个精彩成功故事。“研究所多个部门的专业知识对我们团队的发现至关重要，”他说。

　　“生物学的未来在于合作，在于应用新技术解决复杂问题，并揭示我们身体如何运作的新细节。”这只是多学科研究的力量和潜力的一个例子。”

　　来源:https://www.wehi.edu.au/news/new-breast-cell-types-discovered-multidisciplinary-research-team