800年前，在古代传说中的城市特洛伊(Troy)郊区一个贫困的农业社区，一位30岁的妇女被安葬在一座石砌的坟墓里。

　　就像拜占庭时代墓地里的其他人一样，这名妇女的骨头上有明确无误的迹象，表明她是一个艰苦的农民。但另一件事引起了

　　艾宾根大学特洛伊计划的考古学家亨利克·基塞韦特(Henrike Kiesewetter)的注意，她在整理这具骨架时发现了两个钙化的结节，每个都有草莓大小，坐落在胸部底部，就在肋骨下方。

　　“最初的想法是，这些是由肺结核引起的结核，”威斯康星大学麦迪逊分校病原体进化专家、医学和医学微生物学教授凯特琳·佩佩ell说。结核病是一种细菌感染，其特征通常是在肺部或其他组织中生长钙化结节。然而，对圆形白色结石的DNA、元素和显微分析排除了肺结核、泌尿系统结石或肾结石的可能性。

　　打开结核，研究人员发现了保存非常完好的微化石，矿化的“鬼细胞”，与葡萄球菌属的细菌非常相似，葡萄球菌属的细菌包括高致病性的金黄色葡萄球菌。

　　这些结核和锁在同心钙层中的DNA被送到麦克马斯特大学的亨德里克·波因纳尔那里，他是古代DNA专家，他的实验室以从古代考古和古生物遗骸中提取和重建遗传物质的能力而闻名。

　　“令人惊讶的是，这些样本产生了足够的DNA来完全重建两种细菌的基因组，腐生葡萄球菌和阴道加德纳菌，这两种细菌感染了这名妇女，并可能导致她的死亡，”波因纳尔说。

　　本周(2017年1月10日)，由Pepperell和Poinar领导的一个团队在《eLife》杂志上发表了一篇文章，提供了这种致命感染的分子图谱。这项工作有助于深入了解拜占庭帝国晚期(大约13世纪初)生活中的日常危险，以及一种常见的细菌病原体腐生葡萄球菌的进化。

　　“钙化作用制造了DNA的小手提箱，并在800年的时间跨度内将其运送过去，”佩佩尔说，这些结节是在这位妇女还活着的时候形成的，它们把细菌病原体包裹在钙中，保存了它们的遗传物质。“在这种情况下，古代DNA的数量和完整性是非凡的。一个人通常只能得到不到1%的目标生物。”

　　佩佩ell说，这些结节也含有这名妇女的人类DNA和看起来是她的男性胎儿的DNA，但保存下来的DNA中有31%到58%来自导致这名妇女感染的细菌。佩佩ell说:“这些材料的保存方式非常有趣。”“基因数据的质量是无与伦比的。”

　　她说，物证表明，这名妇女的死亡原因是绒毛膜羊膜炎，这是一种胎盘、羊水和胎儿周围膜的细菌感染，发生在拜占庭帝国衰落的几十年里。除了这名妇女的DNA和导致她感染的细菌的DNA外，研究人员还发现了古老的Y染色体DNA，很可能是男性胎儿的DNA。

　　“相当多的女性死于怀孕和分娩期间的并发症，”eLife报告的合著者Kiesewetter指出。

　　Poinar指出，在化石记录中发现母亲败血症的案例是独一无二的:“在任何地方都没有这样的记录，”他说。“到目前为止，我们几乎没有从考古记录中获得关于孕产妇健康和死亡状况的证据。”

　　从古代材料中提取DNA的能力，在这种情况下，重建导致致命感染的微生物基因组，有助于填补8世纪前农村日常生活的画面。

　　佩佩ell解释说，腐生葡萄球菌的菌株与今天感染人类的典型菌株不同，与在牲畜身上发现的菌株更接近。“特洛伊分离物处于牛和人类相关葡萄球菌之间的这个非常有趣的位置。看起来导致她患病的细菌与我们今天看到的与人类感染相关的细菌处于不同的生态位。”

　　她指出，腐生葡萄球菌的基因蓝图，为“我们拥有DNA的古代细菌——霍乱、肺结核、麻风病、鼠疫——增加了一个相当短的名单。”

　　一些葡萄球菌菌株，如金黄色葡萄球菌，通常在人体皮肤上发现，通常不会对健康构成威胁。但是，如果这种细菌深入人体，就会引起严重甚至致命的感染。

　　另一方面，腐生葡萄球菌可以从环境中获得。佩佩ell解释说:“来自特洛伊的菌株属于一个在现代世界中通常与人类疾病无关的谱系。”他指出，历史记录表明拜占庭农民通常与他们的牲畜生活在一起。“我们推测，在古代世界，人类感染的疾病是由一群在人类、牲畜和环境之间流动的细菌获得的。”

　　Kiesewetter说:“对特洛伊晚期拜占庭墓葬的骨学分析结果与农村人口的图景非常吻合。”这些墓葬位于城市废墟中，最著名的是荷马史诗《伊利亚特》中讲述的特洛伊战争的背景。当时超过一半的骨骼都有脊柱和关节的退化，据信这是一种在田野里从事艰苦劳动的生活。

　　Kiesewetter解释说:“人们在身体紧张和传染病中挣扎，只有少数人活过了50岁。”“许多新生儿在婴儿期夭折，几乎所有儿童的骨骼都显示出营养不良和感染的迹象。”她补充说，人口中猖獗的蛀牙可能是农村饮食中富含无花果和枣子等水果的结果。

　　佩佩ell指出，细菌DNA的保存，就像感染本身一样，很可能是女性怀孕的产物。“胎盘很容易钙化，因为有大量的钙流向胎儿。生物矿化过程可以非常迅速地发生。”