新技术可以更快、更准确地追踪COVID-19和其他病毒

   日期:2024-11-21     来源:本站    作者:admin    浏览:70    
核心提示:      新墨西哥大学计算基因组学与技术实验室(cat)主任杰里米·爱德华兹(Jeremy Edwards)和他在加利福尼亚州帕洛阿尔托和

  

  

  新墨西哥大学计算基因组学与技术实验室(cat)主任杰里米·爱德华兹(Jeremy Edwards)和他在加利福尼亚州帕洛阿尔托和西弗吉尼亚大学的Centrillion Technologies公司的同事们开发了一种芯片,为COVID-19等病毒提供了一种更简单、更快速的基因组测序方法。

  他们的研究题为“基于芯片的高度精确的SARS-CoV-2临床样本重测序”,最近发表在美国化学学会的《朗缪尔》杂志上。作为研究的一部分,科学家们开发了一种平铺基因组阵列,用于快速、廉价的全病毒基因组重测序,并应用他们的SARS-CoV-2特异性基因组平铺阵列,快速、准确地重新测序了来自怀俄明州8个临床样本的病毒基因组,这些样本来自SARS-CoV-2检测呈阳性的患者。最终,他们能够对每个样本95%的基因组进行测序,准确率超过99.9%。

  全球有超过1.42亿人感染了该病毒,警惕检测和接触者追踪是减缓COVID-19传播的最有效方法。传统的临床检测方法经常产生假阳性或假阴性,传统的测序方法既耗时又昂贵。这项新技术将几乎消除所有这些障碍。

  爱德华兹说:“自从提交论文以来,这项技术已经进一步发展,提高了准确性和灵敏度。”“芯片技术是大规模病毒基因组监测和监测病毒变异的最佳技术。这项技术不仅可以帮助控制这次大流行,还可以防止未来的大流行。”

  计算基因组学与技术实验室的任务是为本科生、硕士生、博士生以及博士后提供生物信息学研究方面的培训;为新墨西哥大学的研究人员提供利用生物信息学计算工具的合作研究互动,并在中心内进行最先进和创新的生物信息学和基因组学研究。

 
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